MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bacillus cereus NC7401 plasmid pNC1

Total Repeats: 263

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016772	TTCT	2	8	64	71	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_016772	CTT	2	6	73	78	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_016772	T	6	6	77	82	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016772	TGT	2	6	161	166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016772	ATGT	2	8	177	184	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016772	CAC	2	6	221	226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_016772	TCT	2	6	229	234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_016772	T	6	6	314	319	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016772	TCT	2	6	346	351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_016772	GGT	2	6	360	365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016772	GTTA	2	8	530	537	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016772	CATA	2	8	610	617	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_016772	AAATCT	2	12	705	716	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_016772	TCGT	2	8	837	844	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_016772	TCT	2	6	862	867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_016772	TA	3	6	893	898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016772	TCA	2	6	939	944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_016772	CCT	2	6	987	992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_016772	CA	3	6	1012	1017	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_016772	ATTA	2	8	1071	1078	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016772	ACA	2	6	1079	1084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_016772	AG	3	6	1110	1115	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016772	GGA	2	6	1139	1144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016772	AAG	2	6	1213	1218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016772	TCT	2	6	1242	1247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_016772	TTG	2	6	1253	1258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016772	GGA	2	6	1272	1277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016772	GGA	2	6	1292	1297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016772	TTA	2	6	1334	1339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016772	AAT	2	6	1381	1386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016772	AAT	2	6	1399	1404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016772	A	7	7	2632	2638	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016772	GAA	2	6	2677	2682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016772	CTA	2	6	2707	2712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_016772	ATG	2	6	2741	2746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016772	GAA	2	6	2770	2775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016772	TTAA	2	8	2797	2804	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016772	TAA	2	6	2821	2826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016772	CCT	2	6	2850	2855	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_016772	CT	3	6	2854	2859	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_016772	CAG	2	6	2871	2876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_016772	AG	3	6	2914	2919	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016772	GGA	2	6	2920	2925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016772	GTC	2	6	3881	3886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_016772	T	6	6	3924	3929	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016772	GCC	2	6	4211	4216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_016772	TAAAAA	2	12	5757	5768	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016772	TTG	2	6	5792	5797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016772	TCT	2	6	5850	5855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_016772	TTAA	2	8	5865	5872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016772	ACA	2	6	5913	5918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_016772	TCA	2	6	5937	5942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_016772	AAT	2	6	5959	5964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016772	TCC	2	6	6495	6500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_016772	CCT	2	6	12927	12932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_016772	A	6	6	12951	12956	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016772	GTTATT	2	12	16854	16865	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016772	ATCT	2	8	16875	16882	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_016772	CTT	2	6	17624	17629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_016772	ATT	2	6	17640	17645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016772	AGT	2	6	17648	17653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016772	AAG	2	6	17725	17730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016772	TTC	2	6	17784	17789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_016772	CTT	2	6	17828	17833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_016772	TATT	2	8	17869	17876	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016772	AAATT	2	10	17947	17956	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016772	T	6	6	17988	17993	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016772	A	6	6	18017	18022	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016772	ATTA	2	8	18492	18499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016772	CCT	2	6	18500	18505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_016772	TA	4	8	18536	18543	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016772	CT	3	6	18631	18636	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_016772	TTTA	2	8	18727	18734	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016772	TC	3	6	18738	18743	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_016772	AGC	2	6	20039	20044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_016772	CTTC	2	8	20047	20054	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_016772	TAA	2	6	20170	20175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016772	CTT	2	6	20182	20187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_016772	TCA	2	6	20235	20240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_016772	TTTTAC	2	12	20264	20275	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_016772	CAT	2	6	20291	20296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_016772	A	7	7	20309	20315	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016772	CT	4	8	20330	20337	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_016772	TAT	2	6	21257	21262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016772	CACC	2	8	26732	26739	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
86	NC_016772	CTC	3	9	26773	26781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_016772	ATT	3	9	26795	26803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016772	TA	3	6	27254	27259	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016772	A	6	6	27264	27269	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016772	ACT	2	6	27451	27456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_016772	TAA	2	6	27464	27469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016772	ATCTG	2	10	27473	27482	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
93	NC_016772	CAA	2	6	27485	27490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_016772	TCA	2	6	27712	27717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_016772	TAAC	2	8	27756	27763	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_016772	A	6	6	27798	27803	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016772	AT	4	8	27885	27892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016772	CTTTT	2	10	27999	28008	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_016772	TCGT	2	8	28009	28016	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_016772	GTTT	2	8	28024	28031	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016772	TTA	2	6	28089	28094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016772	GAT	2	6	28106	28111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016772	ATTA	2	8	28116	28123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016772	AT	3	6	28126	28131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016772	CAG	3	9	28208	28216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_016772	CTT	2	6	28217	28222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_016772	CAA	2	6	28287	28292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_016772	TTTC	2	8	28296	28303	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_016772	AT	3	6	28312	28317	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016772	AAC	2	6	28339	28344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_016772	TAT	2	6	28389	28394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016772	TTC	2	6	28731	28736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_016772	TC	3	6	28779	28784	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_016772	CAT	2	6	28788	28793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_016772	TCC	2	6	28797	28802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_016772	TCC	2	6	29105	29110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_016772	TA	3	6	29158	29163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016772	A	7	7	29170	29176	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016772	ACC	2	6	29217	29222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_016772	ACC	2	6	29249	29254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_016772	ATA	2	6	29271	29276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016772	TCCC	2	8	29278	29285	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
123	NC_016772	CAA	2	6	29299	29304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_016772	ACAAA	2	10	29321	29330	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_016772	CTA	2	6	29345	29350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_016772	T	6	6	29390	29395	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016772	AGT	2	6	29452	29457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016772	AC	3	6	29500	29505	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_016772	TCT	2	6	29538	29543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_016772	TTC	2	6	29636	29641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_016772	CAAA	2	8	29705	29712	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_016772	GTC	2	6	29770	29775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_016772	GTGAA	2	10	29783	29792	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016772	TTTC	2	8	29811	29818	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_016772	ATAA	2	8	29843	29850	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016772	ACC	2	6	29851	29856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_016772	CCATT	2	10	29857	29866	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
138	NC_016772	AG	3	6	29883	29888	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016772	ATA	2	6	29946	29951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016772	TCT	2	6	30048	30053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_016772	ACC	2	6	30068	30073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_016772	CCG	2	6	30092	30097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_016772	TTG	2	6	30118	30123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016772	AATA	2	8	30174	30181	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_016772	TGA	2	6	30230	30235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_016772	GATAAT	2	12	30244	30255	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
147	NC_016772	CATT	2	8	30266	30273	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_016772	TTC	2	6	30285	30290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_016772	T	8	8	30317	30324	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_016772	TGTT	2	8	30777	30784	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_016772	CA	3	6	31758	31763	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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184	NC_016772	GA	3	6	33741	33746	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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189	NC_016772	GTGTT	2	10	34723	34732	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
190	NC_016772	TCT	2	6	34785	34790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.